Le terme « barrages » a longtemps désigné la rencontre entre perdants de C1 et gagnants de C2. Depuis 2023, le format a changé.
Pendant près de vingt ans, la “manche de barrage” a opposé, avant la phase de groupes, les perdants du dernier tour de Ligue des champions aux qualifiés de Coupe de la Confédération. En juillet 2023, la CAF a supprimé ces barrages : les vainqueurs du deuxième tour préliminaire de C2 vont directement en phase de groupes. Conséquence : un calendrier plus lisible et des charges réduites pour les clubs. 
Pour 2025/26, la route est donc simple :
• Premier tour préliminaire : 19–21 septembre (aller), 26–28 septembre (retour).
• Deuxième tour préliminaire : 17–19 octobre (aller), 24–26 octobre (retour).
• Les 16 vainqueurs du deuxième tour rejoignent la phase de groupes (début fin novembre).
Points pratiques pour les clubs et supporters :
• Règle de l’extérieur en cas d’égalité, puis tirs au but directement (pas de prolongation) en qualifications.
• Inscription des joueurs à respecter (fenêtres CAF) et stades homologués.
• En cas d’élimination au premier ou deuxième tour, la CAF prévoit désormais une aide logistique (100 000 $) — mesure alignée avec celle de la CAFCL.